Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRNQ16849 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms