Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPROQ16827 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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