Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDGFRLQ15198 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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