Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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