Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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