Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms