Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms