Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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