Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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