Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms