Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK13Q14004 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms