Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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GTF2H2Q13888 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GTF2H2Q13888 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GTF2H2Q13888 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GTF2H2Q13888 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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