Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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