Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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