Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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