Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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