Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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