Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT88Q13099 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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IFT88Q13099 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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IFT88Q13099 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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