Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM2Q13029 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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