Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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