Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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