Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FOXD4Q12950 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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