Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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