Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELP6Q0PNE2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms