Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms