Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms