Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABPB1Q06547 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms