Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RELAQ04206 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms