Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms