Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms