Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ID3Q02535 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ID3Q02535 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ID3Q02535 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ID3Q02535 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms