Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms