Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMF1P82094 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms