Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms