Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms