Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms