Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC11A1P49279 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms