Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms