Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC1P41238 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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