Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms