Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA3P34903 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms