Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX2P28328 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms