Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSFA2P28290 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms