Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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