Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BGNP21810 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BGNP21810 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BGNP21810 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms