Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms