Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms