Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDSP20132 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDSP20132 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDSP20132 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDSP20132 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDSP20132 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SDSP20132 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms