Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD53P19397 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD53P19397 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD53P19397 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms