Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL6A2P12110 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms